MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli SE15 plasmid pECSF1

Total Repeats: 418

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013655	CCG	2	6	1977	1982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_013655	GCA	2	6	1994	1999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013655	CAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013655	ATG	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013655	GGT	2	6	3304	3309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013655	TG	3	6	3322	3327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013655	GGCG	2	8	3608	3615	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013655	GCT	2	6	3676	3681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013655	GGT	2	6	3690	3695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013655	AAC	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013655	GCG	2	6	3785	3790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013655	GCG	2	6	4177	4182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013655	GTT	2	6	4194	4199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013655	GAT	2	6	4475	4480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013655	AG	4	8	4495	4502	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013655	TGA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013655	TTG	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013655	TGT	2	6	4837	4842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013655	GGGA	2	8	4854	4861	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013655	T	6	6	4880	4885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013655	TAT	2	6	5784	5789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013655	TTC	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013655	GTC	2	6	5809	5814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013655	AGG	2	6	5887	5892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013655	TA	4	8	5909	5916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013655	TG	4	8	5977	5984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013655	AAT	2	6	6575	6580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013655	TGG	2	6	6612	6617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013655	CAC	2	6	6622	6627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_013655	CAC	2	6	6634	6639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_013655	AC	3	6	6638	6643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013655	AAT	2	6	6699	6704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013655	ATTT	2	8	6713	6720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013655	TAA	3	9	6797	6805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013655	AAC	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013655	GTGAT	2	10	6844	6853	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013655	TGC	2	6	6855	6860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013655	CGATT	2	10	6890	6899	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013655	AAAT	2	8	6930	6937	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013655	TGA	2	6	7409	7414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013655	ATTA	2	8	7437	7444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013655	T	8	8	8265	8272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013655	TTA	2	6	8298	8303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013655	CGG	2	6	13681	13686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013655	GGA	2	6	13769	13774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013655	ATA	2	6	14539	14544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013655	ATGAA	2	10	14790	14799	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013655	AT	3	6	14804	14809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013655	AT	3	6	15075	15080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013655	T	6	6	15106	15111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013655	CA	3	6	24305	24310	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013655	ATA	2	6	24347	24352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013655	TAT	2	6	30526	30531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013655	AGG	2	6	31301	31306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013655	CCT	2	6	31320	31325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_013655	AAAT	2	8	31371	31378	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013655	AAAT	2	8	31402	31409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013655	CAT	2	6	32238	32243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013655	CTGATT	2	12	43021	43032	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013655	TAA	2	6	43035	43040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013655	ACA	2	6	43041	43046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013655	AGT	2	6	43975	43980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013655	GGA	2	6	43992	43997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013655	CCT	2	6	44591	44596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013655	AGG	2	6	44606	44611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013655	CTT	2	6	44637	44642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013655	AGA	2	6	44654	44659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013655	GGAA	2	8	44705	44712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013655	T	7	7	44987	44993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013655	T	6	6	45041	45046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013655	GT	3	6	45106	45111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013655	TCAT	2	8	45649	45656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013655	TAAT	2	8	45898	45905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013655	AC	3	6	49063	49068	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013655	TTA	2	6	49163	49168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013655	CGG	2	6	51750	51755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013655	A	6	6	51825	51830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013655	GTA	2	6	51833	51838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013655	GAG	2	6	51870	51875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013655	CTT	2	6	52151	52156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013655	TGGC	2	8	52206	52213	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013655	A	6	6	52264	52269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013655	CGA	2	6	52301	52306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013655	AGA	2	6	52307	52312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013655	CAA	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013655	CTT	2	6	52394	52399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013655	GCTC	2	8	52405	52412	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013655	CCT	2	6	53305	53310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013655	AAT	2	6	53314	53319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013655	GGA	2	6	53332	53337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013655	A	7	7	53367	53373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013655	CAC	2	6	53377	53382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013655	A	6	6	53387	53392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013655	TCA	2	6	53398	53403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013655	TC	3	6	53426	53431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013655	ACT	2	6	53597	53602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013655	CATT	2	8	53609	53616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013655	CCTGT	2	10	53639	53648	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_013655	GACA	2	8	53650	53657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013655	GCG	2	6	53679	53684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013655	ACA	2	6	53710	53715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013655	CTC	2	6	53774	53779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013655	GCCCC	2	10	53794	53803	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_013655	TGT	2	6	53843	53848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013655	CTGG	2	8	53878	53885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013655	TCG	2	6	53962	53967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013655	CT	3	6	53993	53998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013655	ATCA	2	8	54053	54060	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013655	CGG	2	6	54082	54087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013655	ACA	2	6	54110	54115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013655	GCC	2	6	54120	54125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013655	A	6	6	54170	54175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013655	CAC	2	6	54228	54233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_013655	GGT	2	6	54237	54242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013655	TC	4	8	54244	54251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013655	T	6	6	54284	54289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013655	GGT	2	6	54310	54315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013655	ATC	2	6	54325	54330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013655	AAT	2	6	55117	55122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013655	CAT	2	6	55222	55227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013655	CGA	2	6	55231	55236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013655	GAT	2	6	55237	55242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013655	GGT	2	6	55276	55281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013655	GAAA	2	8	55282	55289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013655	T	6	6	55835	55840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013655	TGC	2	6	55894	55899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013655	T	6	6	55900	55905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013655	TTA	2	6	55917	55922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013655	T	6	6	55923	55928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013655	TGAA	2	8	55981	55988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013655	CTGC	2	8	56841	56848	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_013655	AAT	2	6	56857	56862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013655	GCCT	2	8	56901	56908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013655	TG	4	8	56965	56972	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013655	TCA	2	6	56974	56979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013655	TGA	2	6	56985	56990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013655	GTC	2	6	57009	57014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013655	ATA	2	6	57065	57070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013655	GTT	2	6	59056	59061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013655	AGG	2	6	59631	59636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013655	CCG	2	6	59693	59698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_013655	ACG	2	6	64672	64677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013655	GA	3	6	64684	64689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013655	TCT	2	6	65207	65212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013655	AAC	2	6	65283	65288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013655	T	6	6	66052	66057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013655	CCA	2	6	66058	66063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_013655	ACT	2	6	66680	66685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013655	GCCA	2	8	66697	66704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_013655	CCTG	2	8	66760	66767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_013655	GAG	2	6	66782	66787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013655	CTTG	2	8	66810	66817	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013655	GCT	2	6	66858	66863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013655	TCC	2	6	66929	66934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_013655	GTG	2	6	66962	66967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_013655	TTC	2	6	67006	67011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_013655	ATC	2	6	67037	67042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013655	TTG	2	6	67151	67156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013655	T	6	6	69201	69206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_013655	TTATTG	2	12	69260	69271	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013655	ATT	3	9	69272	69280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013655	TGT	2	6	69296	69301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013655	AAAG	2	8	69330	69337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013655	TATTT	2	10	69699	69708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_013655	TTA	2	6	69788	69793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013655	GTT	2	6	69869	69874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_013655	TATTTT	2	12	69924	69935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013655	GTG	2	6	69995	70000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_013655	TTC	2	6	70119	70124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_013655	TAT	2	6	70181	70186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013655	A	6	6	70248	70253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013655	TCT	2	6	70274	70279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_013655	GCT	2	6	70344	70349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_013655	TAGA	2	8	70394	70401	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013655	CAG	2	6	70453	70458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_013655	A	7	7	70511	70517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_013655	T	7	7	70581	70587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_013655	ATT	2	6	70613	70618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013655	AAAT	2	8	70680	70687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_013655	GGT	2	6	70711	70716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_013655	AAAC	2	8	71109	71116	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_013655	CTGG	2	8	71166	71173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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276	NC_013655	TA	3	6	93961	93966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_013655	TCA	2	6	93974	93979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_013655	A	6	6	95330	95335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_013655	TTA	2	6	95347	95352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_013655	CTC	2	6	95368	95373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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285	NC_013655	GTAA	2	8	95436	95443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
286	NC_013655	ATTT	2	8	95456	95463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013655	TCG	2	6	95466	95471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_013655	ATA	2	6	95474	95479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013655	AGA	2	6	95496	95501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013655	CATG	2	8	95561	95568	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_013655	TTA	2	6	95602	95607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_013655	GA	3	6	122043	122048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
418	NC_013655	GAT	2	6	122339	122344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.